“建立全球傳染病疫情信息智能監(jiān)測(cè)預(yù)警、口岸精準(zhǔn)檢疫的口岸傳染病預(yù)防控制體系和種類齊全的現(xiàn)代口岸核生化有害因子防控體系，建立基于源頭防控、境內(nèi)外聯(lián)防聯(lián)控的口岸突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)對(duì)機(jī)制，健全口岸病媒生物及各類重大傳染病監(jiān)測(cè)控制機(jī)制，主動(dòng)預(yù)防、控制和應(yīng)對(duì)境外突發(fā)公共衛(wèi)生事件?！?/span>
——摘自中共中央、國(guó)務(wù)院印發(fā)的《“健康中國(guó)2030”規(guī)劃綱要》
輸入性病媒生物引發(fā)的各種傳染病是世界性公共衛(wèi)生問(wèn)題之一，全球一體化為病媒傳染病的傳播提供了機(jī)會(huì)。因此，為減少輸入性病媒物種對(duì)公共衛(wèi)生和生態(tài)的威脅，作為一國(guó)之門的海關(guān)口岸，具備及時(shí)、精準(zhǔn)監(jiān)測(cè)病媒物種及其攜帶微生物的能力非常重要。
目前口岸現(xiàn)有的輸入性病媒生物的傳統(tǒng)形態(tài)識(shí)別方法存在很多困難，如無(wú)法識(shí)別若蟲、卵等非成蟲態(tài)病媒、肢體殘肢不全的昆蟲、雌蟲及近緣種，在識(shí)別過(guò)程中由于缺少參考資料和參比標(biāo)本、數(shù)據(jù)共享性差以及缺少形態(tài)鑒定專家等原因，無(wú)法準(zhǔn)確快速鑒定。
采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)病媒生物監(jiān)測(cè)，能夠快速、精準(zhǔn)地識(shí)別輸入性病媒生物的物種及近緣種，解決物種識(shí)別受蟲態(tài)和蟲體不完整等限制問(wèn)題，可減少病媒生物本身及其攜帶病原體的擴(kuò)散機(jī)會(huì)。
為此，針對(duì)海關(guān)病媒物種的監(jiān)測(cè)，華大智造基于MGISEQ-200測(cè)序平臺(tái)，特別提供了病媒物種及微生物識(shí)別組合產(chǎn)品，該組合產(chǎn)品有以下特點(diǎn)：
01
一站式快速、精準(zhǔn)檢測(cè)
覆蓋從樣本到報(bào)告全流程，一次實(shí)驗(yàn)即可同時(shí)識(shí)別病媒生物物種及其攜帶微生物，為出入境檢驗(yàn)檢疫和病媒防控提供全套工具支撐。
02
為工作人員降低操作門檻
包含豐富的物種數(shù)據(jù)庫(kù)和強(qiáng)大的分析功能，覆蓋9類病媒生物的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)，并收錄細(xì)菌、真菌、病毒等2萬(wàn)多種微生物數(shù)據(jù)（可定期更新），簡(jiǎn)單操作即可自動(dòng)生成病媒物種及其攜帶微生物的識(shí)別分析報(bào)告。
測(cè)試報(bào)告結(jié)果展示
以12例病媒模擬樣本為例(含6例DNA樣本、6例RNA樣本)，采用華大智造病媒測(cè)序組合產(chǎn)品，對(duì)病媒物種及其攜帶微生物的類型進(jìn)行精準(zhǔn)識(shí)別。識(shí)別結(jié)果包括但不限于：病媒物種識(shí)別結(jié)果、病媒生物線粒體組裝序列深度分布圖、病媒所攜帶的微生物類型識(shí)別等。這些結(jié)果的輸出，對(duì)于海關(guān)工作人員而言，可以精準(zhǔn)判斷病媒物種及其攜帶微生物類型，以快速應(yīng)對(duì)境外突發(fā)公共衛(wèi)生事件。
結(jié)果1：
病媒物種識(shí)別
對(duì)12例樣本進(jìn)行檢測(cè)，系統(tǒng)自動(dòng)輸出物種識(shí)別結(jié)果及線粒體的組裝序列，混合樣本輸出2條結(jié)果，所有樣本的病媒物種識(shí)別結(jié)果完全符合預(yù)期。
表1：病媒物種識(shí)別結(jié)果
結(jié)果2：
病媒生物線粒體組裝序列深度分布圖
該組合產(chǎn)品可對(duì)每份樣本中比對(duì)到物種線粒體基因組的序列進(jìn)行組裝，再將組裝后的序列中比對(duì)到數(shù)據(jù)庫(kù)中的COI參考序列做深度分析，以S2樣本為例，深度分布如圖1所示。
圖1 樣本S2的組裝序列深度分布圖
結(jié)果3：
病媒所攜帶的微生物類型識(shí)別
對(duì)樣本中所攜帶的微生物物種進(jìn)行識(shí)別，以S1樣本為例，結(jié)果如表2所示，識(shí)別結(jié)果符合預(yù)期，目標(biāo)微生物均被識(shí)別出，其他非目標(biāo)微生物為病媒樣本自身攜帶的其他微生物。
表2 樣本S1的微生物識(shí)別結(jié)果
總結(jié)
對(duì)病媒生物及其攜帶微生物的及時(shí)有效監(jiān)測(cè)是口岸公共衛(wèi)生防控的重要工作?；贛GISEQ-200測(cè)序平臺(tái)的病媒物種及微生物識(shí)別組合產(chǎn)品，具有識(shí)別結(jié)果準(zhǔn)確、分析功能豐富、操作簡(jiǎn)便的特點(diǎn)。此外，華大智造也可提供基于DNBSEQ-G99測(cè)序平臺(tái)的適配方案，以滿足用戶需要進(jìn)一步縮短檢測(cè)時(shí)間的應(yīng)用需求。
總而言之，華大智造病媒監(jiān)測(cè)組合產(chǎn)品覆蓋了從樣本到報(bào)告的全工作流程，一次實(shí)驗(yàn)可同時(shí)完成病媒生物物種及其攜帶微生物類型的識(shí)別，為出入境檢驗(yàn)檢疫和病媒傳染病防控提供了強(qiáng)大的工具支撐。
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