近日，2022傳染病移動監(jiān)測應(yīng)急演練在中國疾病預(yù)防控制中心昌平園區(qū)圓滿完成。此次演練由中國疾病預(yù)防控制中心衛(wèi)生應(yīng)急中心、實驗室管理處、以及傳染病預(yù)防控制所共同組織，旨在演練并評測移動實驗室開展傳染病監(jiān)測和病原檢測的能力，探索移動式高等級生物安全實驗室開展自然疫源性傳染病野外監(jiān)測、病原快速篩查、現(xiàn)場基因測序和分析研判的工作模式。
圖：6輛移動式實驗室出發(fā)應(yīng)急演練
在為期4天的演練中，華大智造數(shù)字化樣本制備系統(tǒng)DNBelab-D4與小型化基因測序儀DNBSEQ-E25強強聯(lián)合，小巧便攜、隨到隨測的性能助力演練隊員針對野外采集的鼠類樣本順利完成了鼠疫和炭疽的應(yīng)急快速檢測和測序檢測。DNBelab-D4與DNBSEQ-E25大小相當(dāng)，30厘米見方，插電即可搭配使用。DNBelab-D4開創(chuàng)性地實現(xiàn)“一卡建庫，集成定量”，DNBSEQ-E25測序速度快、操作簡易，大大降低了基因測序儀的使用門檻。兩款產(chǎn)品組合能夠?qū)崿F(xiàn)快速部署并快速處置突發(fā)性的單個或少量樣本，滿足野外環(huán)境移動檢測的緊急測序場景需求，真正做到了上山下海、開箱即用。
圖：演練隊員在移動測序車內(nèi)開展樣本宏基因組測序及分析
2022傳染病移動監(jiān)測應(yīng)急演練的圓滿完成也是CLOSS模型的又一次成功實踐。CLOSS為Co-Localization of Sampling and Sequencing的縮寫，CLOSS模型由中疾控移動實驗室監(jiān)測專家團隊提出，是指在開展野外環(huán)境病原體檢測中，利用移動測序車在現(xiàn)場點完成采樣和測序工作，并且是通過高通量宏基因組測序技術(shù)，在野外就地對野生動物攜帶病原體進行檢測，通過移動實驗室的轉(zhuǎn)移開展多點連續(xù)監(jiān)測，從而擴大監(jiān)測面，能夠?qū)Χ喾N病原體及其環(huán)境分布情況進行調(diào)查。
圖：CLOSS模型野外采樣、基因組測序及病原檢測流程
CLOSS模型通過建立移動實驗室，可以實現(xiàn)流動監(jiān)測，在采樣地直接開始檢測，節(jié)省時間，避免樣品運輸帶來的生物安全問題，擴大監(jiān)測覆蓋度；且在移動監(jiān)測中開展高通量宏基因組測序，可以實行病原一網(wǎng)打盡式的檢測，突破目前檢測中僅針對固定病原檢測、缺乏多病原篩查和整體數(shù)據(jù)的限制。華大智造DE高通量測序產(chǎn)品組合（DNBelab-D4+DNBSEQ E系列測序儀）小型便攜、準確度高、速度快、操作簡易，完美匹配在移動監(jiān)測中開展高通量宏基因組測序的場景需求。
2021年9月，中國疾病預(yù)防控制中心聯(lián)合內(nèi)蒙古疾病預(yù)防控制中心，在內(nèi)蒙古自治區(qū)組織了首次傳染病移動監(jiān)測應(yīng)急演練。該演練是CLOSS模型的首次成功實踐，也是華大智造DE高通量測序產(chǎn)品組合首次助力高通量宏基因組測序移動快速部署的成功嘗試。
在該演練對嚙齒類動物體內(nèi)的鼠疫耶爾森菌進行病原學(xué)調(diào)查的過程中：采用傳統(tǒng)的調(diào)查技術(shù)，調(diào)查團隊并沒有在嚙齒類動物樣本中檢測到鼠疫耶爾森菌；但對兩例嚙齒類動物樣本進行宏基因組高通量測序后，在這兩例樣本中都發(fā)現(xiàn)了巴爾通體序列。并且，通過實時熒光PCR的方法進行了進一步的驗證，確定了巴爾通體的存在。
憑借便攜、易用、快捷的高通量測序儀，疾控專家們首次完成了在野外通過高通量宏基因組測序?qū)σ吧鷦游飻y帶病原體的調(diào)查，實現(xiàn)了針對自然疫源性傳染病病原菌的野外環(huán)境中測序監(jiān)測。調(diào)查團隊表示，“華大智造DE高通量測序產(chǎn)品組合便攜靈活的特點，很適合傳染病暴發(fā)事件的快速基因測序和應(yīng)急處置的需求?！?/span>
經(jīng)過多次演練及成功實踐，CLOSS模型未來計劃整合進國家致病菌識別網(wǎng)，在多個網(wǎng)絡(luò)節(jié)點（也就是多地野外環(huán)境中）實現(xiàn)對野外病原菌流行情況的實時監(jiān)測和調(diào)查，可做為致病菌識別網(wǎng)監(jiān)測中深入野外的靈活觸角，是對疫情監(jiān)測多點觸發(fā)的有效補充。
病原學(xué)監(jiān)測預(yù)警離不開先進技術(shù)、核心工具的助力。華大智造致力于成為“生命科技核心工具締造者”，憑借多年的行業(yè)深耕與技術(shù)積累，形成了病原微生物測序一站式產(chǎn)品組合。該組合可滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程、不同應(yīng)用場景的需求，為病原微生物的監(jiān)測和預(yù)警提供國產(chǎn)化核心工具，保障國家生物安全、守護人民健康。
圖：華大智造病原微生物測序一站式產(chǎn)品組合
參考文獻：
[1] Xin Lu, Yao Peng, Yuanyuan Geng, Hongqun Zhao, Xiaona Shen, Dongmei Li, Zhenpeng Li, Liang Localization of Sampling and Sequencing for Zoonotic Pathogen Identification in the Field Monitoring Using Mobile Laboratories[J]. China CDC Weekly, 2022, 4(12): 259-263. doi: 10.46234/ccdcw2022.059
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