2023年1月8日起，我國(guó)對(duì)新型冠狀病毒感染實(shí)施“乙類乙管”。新冠疫情防控進(jìn)入新階段，國(guó)家疾控部門進(jìn)一步完善新冠病毒變異監(jiān)測(cè)的工作方案，在本土病例監(jiān)測(cè)方面，每個(gè)省選擇了部分的城市和醫(yī)院作為監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)，對(duì)門診病例、重癥和死亡病例開(kāi)展一定數(shù)量的新冠病毒感染病例的采樣和序列測(cè)定。
近日，廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院（以下簡(jiǎn)稱廣州市八醫(yī)院）作為”入境患者定點(diǎn)收治醫(yī)院“，一直動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)新冠病毒變異的趨勢(shì)，基于華大智造的MGISEQ-2000基因測(cè)序儀、ATOPlex RNA多重PCR建庫(kù)試劑盒套裝V3.1以及MetargetCOVID軟件，在收治的境外輸入新冠病毒感染者中檢測(cè)出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奧密克戎亞型變異毒株。
測(cè)序報(bào)告顯示測(cè)出BQ.1.25、XBB.1 、XBB.2變異毒株
華大智造MGISEQ-2000是一款靈活高效的測(cè)序平臺(tái)，搭配2種通量的載片：大載片（FCL）和小載片（FCS），可獨(dú)立上機(jī)，單次運(yùn)行數(shù)據(jù)產(chǎn)量可從55Gb到1,440Gb。ATOPlex RNA多重PCR建庫(kù)試劑盒套裝V3.1（簡(jiǎn)稱ATOPlexV3.1）采用328對(duì)混合引物（平均擴(kuò)增178bp）來(lái)捕獲新冠病毒全基因組序列信息，對(duì)于低濃度、易降解的樣本友好、具有極高的靈敏度。而MGI MetargetCOVID軟件支持批量樣本的快速分析，可實(shí)現(xiàn)新冠病毒的準(zhǔn)確分型。
基于華大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID軟件的測(cè)序組合，廣州市八醫(yī)院?jiǎn)未瓮瓿?6*個(gè)新冠樣本的測(cè)序工作，得到病毒序列全長(zhǎng)覆蓋率達(dá)到99%以上，測(cè)序效率高，測(cè)序結(jié)果質(zhì)量?jī)?yōu)異。
廣州市八醫(yī)院工作人員在華大智造MGISEQ-2000上操作新冠樣本測(cè)序早在2021年5月，華大智造啟動(dòng)為廣州市八醫(yī)院提供新冠病毒測(cè)序工具。2021年5月21日至2021年6月18日，廣州市八醫(yī)院共確診159例新冠Delta毒株病例，廣州市八醫(yī)院聯(lián)合廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院等單位采用華大智造的ATOPlex技術(shù)平臺(tái)和MGISEQ-2000測(cè)序儀的測(cè)序組合產(chǎn)品成功實(shí)現(xiàn)對(duì)新冠Delta病毒全基因組的測(cè)序、比對(duì)、分型和溯源。
廣州市八醫(yī)院工作人員使用MGI MetargetCOVID軟件進(jìn)行樣本毒株分型廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院傳染病研究所主任李鋒表示：“在監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)開(kāi)展新冠病毒全基因組測(cè)序，能夠及時(shí)動(dòng)態(tài)掌握人群感染發(fā)病水平和變化趨勢(shì)，科學(xué)研判和預(yù)測(cè)疫情規(guī)模、強(qiáng)度和流行時(shí)間，動(dòng)態(tài)分析病毒株變異情況。華大智造提供的國(guó)產(chǎn)高通量測(cè)序工具組合準(zhǔn)確、高效、操作簡(jiǎn)便，為新冠病毒變異監(jiān)測(cè)提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐?！?/span>
近年來(lái)，高通量測(cè)序技術(shù)在病原的監(jiān)測(cè)和溯源以及公共衛(wèi)生事件的應(yīng)對(duì)中發(fā)揮著極其重要的作用。華大智造始終致力于成為“生命科技核心工具締造者”，針對(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)、公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)開(kāi)展新型冠狀病毒感染疫情監(jiān)測(cè)的需求，持續(xù)提供實(shí)時(shí)、全景、全生命周期的測(cè)序產(chǎn)品組合，助力病毒變異監(jiān)測(cè)，賦能傳染病防控的“醫(yī)防結(jié)合”。
*MGISEQ-2000基因測(cè)序儀單次運(yùn)行可實(shí)現(xiàn)384-3072個(gè)新冠樣品的測(cè)序。
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