國(guó)務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制指出，今年10月以來(lái)，我國(guó)流感、肺炎支原體感染活動(dòng)逐步增強(qiáng)，預(yù)計(jì)流感將出現(xiàn)全國(guó)冬春季流行高峰，肺炎支原體感染未來(lái)一段時(shí)間在部分地區(qū)仍將持續(xù)高發(fā)。各地要統(tǒng)籌做好新冠、流感和諾如病毒胃腸炎等重點(diǎn)傳染病監(jiān)測(cè)，密切跟蹤疫情形勢(shì)變化。
近日，廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院傳染病研究所基于華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合，對(duì)樣本進(jìn)行精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別，獲得了完整的流感病毒基因組序列，成功對(duì)流感病毒進(jìn)行測(cè)序和溯源。
此次流感溯源研究采用MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫(kù)試劑盒套裝對(duì)40例流感陽(yáng)性樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，在MGISEQ-2000上進(jìn)行測(cè)序，搭配華大智造自主研發(fā)的FluTrack軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，對(duì)樣本全基因組的8個(gè)片段進(jìn)行比對(duì)。結(jié)果表明，40例樣本中，36例樣本（占比90%）的流感基因片段比對(duì)率超過(guò)95%，表現(xiàn)出優(yōu)異的基因組測(cè)序覆蓋度。
作為較易發(fā)生突變、而且傳染性較強(qiáng)的高發(fā)病率病毒，流感病毒不僅難以辨別于普通感冒，還會(huì)與新型冠狀病毒的交叉流行帶來(lái)疊加效應(yīng)負(fù)擔(dān)。利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)流感病毒變異進(jìn)行追蹤，對(duì)新型流感病毒做出預(yù)警，對(duì)流感流行趨勢(shì)進(jìn)行監(jiān)測(cè)非常重要。
采用華大智造推出的呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合，能夠?qū)颖具M(jìn)行精準(zhǔn)的流感病毒亞型識(shí)別，獲得完整的流感病毒基因組序列，有助于疾控部門(mén)或科研機(jī)構(gòu)對(duì)流感病毒的追蹤和溯源等工作的高效開(kāi)展和快速推動(dòng)。
圖1：華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合
其中，MGIEasy呼吸道微生物基因組建庫(kù)試劑盒套裝是華大智造采用ATOPlex多重PCR技術(shù)開(kāi)發(fā)而成，能夠?qū)仔土鞲泻鸵倚土鞲胁《救蚪M進(jìn)行高效地?cái)U(kuò)增和文庫(kù)制備；搭配華大智造DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)完成測(cè)序，并使用MGI FluTrack基礎(chǔ)分析系統(tǒng)，可實(shí)現(xiàn)對(duì)流感病毒的分型、基因組組裝和溯源研究。
圖2：華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合提供多種通量方案
華大智造呼吸道微生物基因組測(cè)序產(chǎn)品組合，自動(dòng)化程度高，數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)異，軟件功能強(qiáng)大，能夠?yàn)榱鞲械淖儺惐O(jiān)測(cè)和流行病學(xué)調(diào)查提供強(qiáng)大的工具支撐。
未來(lái)，秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念，在公共衛(wèi)生應(yīng)用領(lǐng)域，華大智造將持續(xù)致力于滿足病原微生物全基因組測(cè)序、靶向測(cè)序和宏基因組測(cè)序全流程等應(yīng)用場(chǎng)景的需求，為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測(cè)和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的國(guó)產(chǎn)化核心工具。
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