近日，由21個機(jī)構(gòu)和10多個參與國家共同努力的全球最大國際微生態(tài)研究計劃——“百萬微生態(tài)” (Million Microbiome of Humans Project,MMHP)披露最新進(jìn)展，基于華大智造測序平臺已完成樣本量測序超13萬例，較過去半年翻倍增長。
MMHP于2019年在國際基因組學(xué)會議(ICG-14)上正式啟動，目標(biāo)是在三到五年內(nèi)對100萬份人類樣本的微生物DNA進(jìn)行測序和分析，重點是糞便和唾液，旨在構(gòu)建世界上最大的人類微生物組數(shù)據(jù)庫。據(jù)了解，項目主要創(chuàng)始成員和聯(lián)盟所在的核心實驗室，如卡羅林斯卡研究所的AmbioGen、丹麥哥本哈根大學(xué)和法國國家農(nóng)業(yè)科學(xué)院宏基因組研究所MetaGenoPolis將承擔(dān)樣本核心測序工作，而其他支持實驗室，如德國ALACRiS Theranostics和法國Nahibu生物技術(shù)公司則發(fā)揮輔助支持作用。
MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院微生物轉(zhuǎn)化研究中心主任Lars Engstrand教授表示：“MMHP旨在利用高通量測序技術(shù)的進(jìn)步，加速和推進(jìn)宏基因組學(xué)研究，這其中一項重點工作就是如何創(chuàng)新和應(yīng)用可大規(guī)模部署的最佳工作流程。這樣所有的參與方都可以使用簡化的流程，產(chǎn)生有價值的數(shù)據(jù)以促進(jìn)高質(zhì)量、全面的腸道微生物組圖譜開發(fā)?！?/span>
在樣品收集的同時，MMHP聯(lián)盟基于華大智造測序和自動化產(chǎn)品，進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)工作流程的最終優(yōu)化工作。這套完整的工作流程將適配測序?qū)嶒炛猩婕暗乃嘘P(guān)鍵點，確保數(shù)據(jù)的質(zhì)量與可靠性。
MMHP聯(lián)盟聯(lián)合主席、倫敦大學(xué)學(xué)院教授Stanislav Dusko Ehrlich教授表示：“一旦認(rèn)識到人類微生物組組成對健康的重要性，微生物組分析在現(xiàn)代醫(yī)療實踐的高結(jié)合度是很容易理解的。因此，加強(qiáng)對這個復(fù)雜的微生物世界的理解變得勢在必行。通過傳播這項技術(shù)并加速這一新興領(lǐng)域的采用，我們的目標(biāo)就是釋放微生物組學(xué)在創(chuàng)新醫(yī)療解決方案的巨大潛力。”
與傳統(tǒng)技術(shù)相比，隨著宏基因組學(xué)的速度和精度越來越受到科學(xué)界的歡迎，MMHP聯(lián)盟致力于通過向參考實驗室轉(zhuǎn)移技術(shù)來分享領(lǐng)域?qū)I(yè)知識。在華大智造先進(jìn)的測序技術(shù)、完善的實驗工作流程及各項目成員的支持下，MMHP的目標(biāo)是在2024年繼續(xù)增強(qiáng)參考實驗室矩陣的能力，使宏基因組學(xué)能夠惠及人人。
MMHP前10,000個樣本的性能分析結(jié)果證實了華大智造DNBSEQ測序平臺具有高度一致性的表現(xiàn)。與常規(guī)DNA陣列相比，DNBSEQ測序技術(shù)具備低重復(fù)序列、低標(biāo)簽跳躍、信號密度高、平衡高通量和高質(zhì)量數(shù)據(jù)的技術(shù)優(yōu)勢。借助DNBSEQ測序技術(shù)，參與機(jī)構(gòu)能夠擴(kuò)展宏基因組學(xué)的應(yīng)用和能力，有助于進(jìn)一步開展相關(guān)研究和精準(zhǔn)醫(yī)療。
除了可以接入標(biāo)準(zhǔn)化的微生物組分析協(xié)議和基于華大智造測序平臺的鳥槍法宏基因組測序外，參與MMHP的其他好處還包括可以提前獲取聯(lián)盟生成的數(shù)據(jù)，并可成為相關(guān)研究論文的共同作者。該項目最終將實現(xiàn)100萬份樣本的測序和分析。當(dāng)前，項目組歡迎醫(yī)學(xué)、科學(xué)及業(yè)界機(jī)構(gòu)的積極參與，共同為研究人類健康和疾病中的微生物組學(xué)作出貢獻(xiàn)，改善全球健康。
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