腸道菌群是一個龐大復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)，占全身菌群總數(shù)的80%左右，被稱為人體的“第二基因組”。腸道菌群在促進人體消化及營養(yǎng)吸收、免疫調(diào)整、合成維生素和其他有益化合物、對抗病原體、影響人體情緒和行為上都發(fā)揮著重要作用。
近年來，全球范圍內(nèi)的科學(xué)家、醫(yī)生及研究人員等開始加大對腸道菌群的研究，如2010年，華大發(fā)表在Nature封面上關(guān)于“構(gòu)建人體腸道微生物參考基因集”的研究論文[1]，開創(chuàng)了高通量測序研究人體腸道菌群的新時代，被稱為21世紀前十年最重要的科研成果之一。
此外，一些大規(guī)模的腸道菌群計劃——如華大智造DNBSEQ測序平臺助力的“百萬微生態(tài)”國際合作計劃（MMHP）等也正在如火如荼地進行中。更重要的是，腸道微生物研究不僅僅停留在科研層面，也在臨床應(yīng)用中取得了進展，業(yè)界已經(jīng)開始探索利用腸道微生物作為治療和預(yù)防疾病的手段。
腸道微生物研究領(lǐng)域的興起，也對樣本收集提出了新的要求。在實際操作中，腸道微生物研究常常面臨樣本提取難，自動化程度低等難題，為此，華大智造推出了MGIEasy糞便基因組DNA（meta）提取試劑盒II。該試劑盒采用超強吸附性的納米磁珠捕獲技術(shù)，可以從人類糞便樣本、唾液及拭子樣本中提取純化高質(zhì)量的微生物基因組DNA，在純度和樣本豐富性方面有了很大的提升。
此外，華大智造也提供糞便樣本全流程自動化提取產(chǎn)品組合，包括全自動MGISTP-7000分杯處理系統(tǒng)進行移液，基于MGISP-NE384、MGISP-960等不同通量的自動化設(shè)備完成核酸提取，滿足用戶在不同場景的提取需求。
產(chǎn)品亮點
樣本類型廣
可提取糞便樣本、拭子樣本及唾液樣本等
提取效率高
有較高的提取產(chǎn)量和純度
提供腸道微生物全流程產(chǎn)品組合
該提取試劑盒適配中/高/超高通量提取設(shè)備，配備糞便樣本采集套裝，提供從樣本采集盒轉(zhuǎn)移、提取、建庫、測序到報告的全流程產(chǎn)品組合
性能介紹
01
不同樣本類型提取性能優(yōu)異
使用MGIEasy糞便基因組DNA（meta）提取試劑盒II分別對糞便樣本（每個反應(yīng)投入1mL糞便懸液250mg糞便樣本左右）、唾液及口腔拭子樣本進行提取。
結(jié)果顯示：1）華大智造的提取試劑對不同類型樣本的提取產(chǎn)量較高；2）華大智造的提取試劑對不同樣本提取的純度高：不僅A260/A280表現(xiàn)優(yōu)異， A260/A230也具備很高的數(shù)值。表明該試劑盒能夠兼容不同樣本類型的提取，且提取性能優(yōu)異。
表1：不同試劑盒對不同類型的提取結(jié)果
02
提供腸道微生物全流程產(chǎn)品組合
針對腸道微生物研究，華大智造推出了覆蓋中/高/超高通量產(chǎn)品組合，優(yōu)化及驗證標準流程，實現(xiàn)了從樣本前處理，提取，建庫，測序到報告的全流程。通過搭配自動化設(shè)備，解決了糞便樣本難處理自動化程度低、糞便樣本處理體驗差等問題，實現(xiàn)樣本前處理高度自動化，很大程度上減少手工操作，大大提高提取效率。
圖1：糞便宏基因組測序流程圖
MGIEasy糞便基因組DNA（meta）提取試劑盒II搭配自動化提取產(chǎn)品組合，從提取結(jié)果可以看出：使用MGISP-960和MGISP-NE384對20份不同樣本進行提取，核酸產(chǎn)量合格率高達100%（需求核酸產(chǎn)量≥200ng），且兩儀器提取產(chǎn)量相當。
圖2：不同設(shè)備提取的產(chǎn)量比較
產(chǎn)品信息
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參考文獻：
[1]Qin J, Li R, Raes J, Arumugam M. et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010 Mar 4;464(7285):59-65.
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