6月28日，華大智造與時空組學相關業(yè)務主體達成合作，將獲得時空組學產品的知識產權授權與全球市場經銷權，為生命科學領域提供更豐富的核心工具。華大智造將負責制造并對外銷售時空自動化樣本處理系統、顯微鏡、時空可視化試劑套裝，并成為時空組學試劑盒、芯片等試劑耗材產品的全球經銷商。即日起，時空組學產品在華大智造同步開放訂購！
近日，“創(chuàng)芯不止·探索無限”時空組學FFPE產品發(fā)布會成功舉行。時空組學主任科學家廖莎正式發(fā)布了時空轉錄組FFPE產品方案，時空組學專項科學家張佳君在發(fā)布會現場啟動了“見‘微’知著——華大時空組學中國區(qū)青年科學家激勵計劃”。
來自上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩、中南大學湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄、中山大學附屬第一醫(yī)院消化內科李曉智博士等行業(yè)專家，分享了時空轉錄組FFPE產品方案在腫瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿應用。
與會嘉賓
華大生命科學研究院副院長方曉東為本次發(fā)布會致辭。他指出，技術革新是社會發(fā)展的引擎，時空組學技術為生命科學領域創(chuàng)新發(fā)展提供了引擎。本次發(fā)布的時空轉錄組FFPE產品方案，創(chuàng)新之處在于其隨機引物技術，它不僅能捕獲宿主RNA，還能捕獲微生物RNA，為深入探索宿主與微生物的相互作用提供了強大工具。最后，他期待能夠攜手更多科研機構，共同推動科技創(chuàng)新，促進科學發(fā)展，將科技的福祉帶給全人類。
華大生命科學研究院副院長方曉東
開辟病理研究新維度
工欲善其事，必先利其器。自2020年發(fā)布了具有“納米級分辨率”與“厘米級全景視場”等突破性優(yōu)勢的時空組學技術Stereo-seq，華大時空組學持續(xù)基于科研應用場景和用戶需求，陸續(xù)推出了時空轉錄組+H&E染色、時空轉錄組兼容多重免疫熒光、時空蛋白轉錄組Stereo-CITE等產品解決方案，進一步完善時空組學技術在科研領域的全鏈條賦能能力，加速生命科學研究領域的突破創(chuàng)新。
福爾馬林固定的石蠟包埋（Formalin-Fixed Paraffin Embedded，FFPE）樣本因其易于保存且能較好地保存樣本組織形態(tài)的特點，在全球醫(yī)學與科研領域被廣泛應用。然而FFPE樣本制備過程中，RNA可能存在降解，這導致Poly T探針無法捕獲，且靶向探針的應用場景受限，因此亟需新的技術方法探究FFPE樣本的組學奧秘。
本次發(fā)布的時空轉錄組FFPE產品方案，利用“隨機探針”對FFPE樣本中組織細胞內的Total RNA分子進行原位捕獲，并通過空間條形碼（Coordinate ID，CID）還原回空間位置，可實現全物種全轉錄組空間表達圖譜的構建。
時空組學主任科學家廖莎，在發(fā)布會上展示了時空轉錄組FFPE產品方案的技術性能及優(yōu)勢。該產品可在同一張切片上實現H&E染色/細胞核染色和基因表達分析。結合納米級捕獲分辨率的優(yōu)勢，利用StereoMap可視化分析工具，用戶可進行真正的空間單細胞水平分析。同時，全新的StereoMap還支持第三方細胞分割工具，以滿足復雜且多樣化的科學研究需求。
時空組學主任科學家廖莎
此外，與常見轉錄組方案相比，時空轉錄組FFPE產品方案還可捕獲發(fā)生降解的RNA片段，也能實現編碼及非編碼RNA的共捕獲，以及宿主與微生物的共檢測。
拓展多元科研應用場景
時空轉錄組FFPE產品方案可應用在疾病研究、細胞圖譜、生物標志物研究、宿主與微生物互作研究、非編碼RNA調控研究等領域。本次發(fā)布會上，來自行業(yè)內的三位專家分享了該產品方案在腫瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿應用。
上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩，分享了時空轉錄組FFPE產品方案與數字智慧病理結合的應用案例。笪老師闡述了數字智慧病理的臨床現狀、時空淋巴瘤智能診斷平臺的設計，以及淋巴瘤時空轉錄組FFPE預實驗數據。笪老師深入探討時空組學技術與人工智能診斷結合，具有提高病理診斷的效率和準確性的臨床應用潛能。她表示，時空組學技術不僅提高了數據的科學性，也為回顧性臨床試驗提供了堅實的數據基礎，推動了個性化診療的發(fā)展。
上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩
中南大學湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄，分享了多模態(tài)數據整合和機器學習在皮膚疾病，尤其是銀屑病治療中的應用。他指出了當前皮膚病治療面對的挑戰(zhàn)，尋找新的靶點是治療皮膚病的關鍵。時空轉錄組FFPE產品方案能夠以近似單細胞分辨率刻畫皮膚組織細胞組分及空間分布，進而可以識別皮膚病中潛在的新治療靶點。
中南大學湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄
中山大學附屬第一醫(yī)院消化內科李曉智博士，在現場分享了時空轉錄組FFPE產品方案在宿主-微生物互作方面的研究。基于時空轉錄組FFPE，李曉智博士在研究中精確描繪腸道各層的顯微結構和細胞分布，同時原位檢測了微生物的空間分布和表達豐度。研究發(fā)現微生物與周圍細胞的互作可以在一定程度上解釋炎癥性腸病的空間異質性，為闡明炎癥性腸病等消化系統疾病的分子機制提供客觀證據。
中山大學附屬第一醫(yī)院消化內科李曉智博士
賦能青年科學家研究創(chuàng)新
為助力青年科學家的科研發(fā)現，華大時空組學于2022年、2023年連續(xù)發(fā)起了兩期“青年科學家激勵計劃”，累計為35個入選項目提供了科研支持。2024年激勵計劃再出發(fā)，時空組學專項科學家張佳君在本次發(fā)布會上，發(fā)布了“見‘微’知著——華大時空組學中國區(qū)青年科學家激勵計劃（第三期）”。
時空組學專項科學家張佳君
該計劃旨在支持廣泛的科研領域，包括但不限于各類疾病研究（動物模型研究、病原微生物研究等），并鼓勵國內青年科研人員利用時空轉錄組FFPE產品方案進行微生物檢測和宿主-微生物互作的科學研究。評審委員會最終將評選出5個科研項目，并為入選項目提供2-4個FFPE樣本的時空轉錄組支持（芯片規(guī)格為1cmx1cm）。生化實驗、測序和標準分析等服務和收費標準由華大時空組學生態(tài)合作伙伴提供。
時空組學照亮浩瀚生命，工具創(chuàng)新助力新質未來。華大時空組學在開發(fā)前沿技術工具的同時，也積極致力于推進全球科研合作和生態(tài)合作伙伴建設，打造時空生態(tài)圈。目前，華大時空組學已與海內外20多家生物科技公司達成合作，時空轉錄組FFPE產品方案也將在各生態(tài)合作伙伴開放訂購。
未來，華大時空組學將繼續(xù)開發(fā)通用且功能強大的工具，攜手生態(tài)合作伙伴，共同助力廣大科研工作者進行更廣、更深層次的組學探索，在生長發(fā)育、生命演化、器官結構、疾病機制等研究領域取得創(chuàng)新突破，推動生命科學行業(yè)加速發(fā)展。
注：時空組學多款產品方案已在華大智造官網上線，時空轉錄組FFPE產品方案同步上新，點擊“閱讀原文”即刻了解。
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